散寒止痛：能温散肝经寒邪，为治肝寒气滞诸痛之主药，可缓解寒凝肝脉所致的厥阴头痛、寒疝腹痛、经行腹痛等。同时，对脾胃虚寒或寒邪客胃引起的脘腹冷痛也有治疗作用。

降逆止呕：可降逆胃气而止呕，常用于治疗胃寒呕吐，也可用于肝胃不和之呕吐吞酸，能和胃降逆，缓解呕吐、反酸等症状。

助阳止泻：有温脾益肾、助阳止泻之功，可用于治疗脾肾阳虚之五更泄泻，能改善晨起腹泻、腹痛喜温等症状。

疏肝下气：能疏肝理气、降泄浊气，对于肝郁气滞、气逆上冲等情况有调理作用，有助于缓解相关的胸闷、胁痛等症状。

内服：一般煎汤，常用量为 2-5 克；或入丸、散。外用适量，研末调敷或煎水洗。

治疗头痛：对厥阴头痛有特殊功效，常表现为巅顶部位疼痛，伴有干呕、吐涎沫等症状，吴茱萸可温散厥阴经寒邪，止痛效果显著。

改善疝气：对于寒疝腹痛，即因寒邪凝滞肝经所致的阴囊坠胀、疼痛等症状，吴茱萸能散寒止痛、疏肝理气，有效缓解疝气疼痛。

调理妇科经痛：在治疗女性寒凝气滞所致的痛经方面效果良好，可改善经期小腹冷痛、经血紫暗有块等症状，通过散寒活血、理气止痛来调理月经。

缓解脚气肿痛：可用于寒湿脚气，表现为足胫疼痛、肿胀，甚至上冲心胸等症状，吴茱萸有散寒燥湿、降逆下气的作用，能减轻脚气症状。

吴茱萸汤：由吴茱萸、人参、生姜、大枣组成。具有温中补虚、降逆止呕的功效，主治肝胃虚寒，浊阴上逆证，如食后泛泛欲呕，或呕吐酸水，或干呕，或吐清涎冷沫等。

四神丸：含吴茱萸、补骨脂、肉豆蔻、五味子等。吴茱萸在方中助阳止泻，与其他药物协同，共奏温肾暖脾、固肠止泻之功，用于治疗脾肾阳虚之五更泄泻。

温经汤：有吴茱萸、当归、川芎、芍药等药物。吴茱萸散寒止痛，与诸药配伍，起到温经散寒、养血祛瘀的作用，主治冲任虚寒、瘀血阻滞证，常用于月经不调、痛经等妇科病症的治疗。

配伍：与生姜配伍，可增强散寒止呕作用，适用于胃寒呕吐；与小茴香配伍，能加强散寒止痛功效，常用于寒疝腹痛、睾丸坠胀疼痛等；与黄连配伍，即左金丸，可用于肝郁化火、肝胃不和之呕吐吞酸，一寒一热，辛开苦降。

炮制：常见的炮制方法有甘草水制、盐制等。甘草水制可降低其毒性，缓和燥性，增强其温中散寒、和胃止呕的作用；盐制则可引药入肾，增强其温肾助阳、止泻的功效。

中毒反应：吴茱萸有小毒，过量服用可能引起中毒，出现头痛、头晕、视力障碍、错觉、脱发、呕吐、腹痛、腹泻等症状，严重者可出现昏迷、抽搐等。

刺激肠胃：可能对胃肠道产生刺激，引起恶心、呕吐、腹痛等不适，尤其是脾胃虚弱者，可能反应更明显。

过敏反应：部分人可能对吴茱萸过敏，使用后出现皮肤瘙痒、皮疹、红斑等过敏症状，应立即停止使用。